Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms