Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms