Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms