Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms