Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms