Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP9P55211 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms