Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms