Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms