Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRPPRCP42704 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms