Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMPOP42166 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMPOP42166 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMPOP42166 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms