Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPARGP37231 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms