Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms