Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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