Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms