Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX2P28328 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX2P28328 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX2P28328 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX2P28328 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PEX2P28328 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PEX2P28328 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms