Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNTFRP26992 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms