Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSHP23434 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSHP23434 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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