Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CALB2P22676 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALB2P22676 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALB2P22676 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALB2P22676 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALB2P22676 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALB2P22676 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CALB2P22676 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CALB2P22676 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms