Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM21P19474 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms