Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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