Protein–RNA interactions for Protein: P13987

CD59, CD59 glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD59P13987 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD59P13987 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD59P13987 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD59P13987 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms