Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms