Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BMP3P12645 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BMP3P12645 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BMP3P12645 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BMP3P12645 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms