Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DMDP11532 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DMDP11532 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DMDP11532 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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