Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms