Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHGAP10645 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHGAP10645 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHGAP10645 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms