Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GLI3P10071 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GLI3P10071 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GLI3P10071 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms