Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms