Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms