Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNC1O60486 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms