Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD6O43541 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD6O43541 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms