Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TO15178 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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