Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms