Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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