Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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