Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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