Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM2AQ9Y2K7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms