Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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