Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms