Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms