Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms