Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT172Q9UG01 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms