Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms