Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PPARGC1AQ9UBK2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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