Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms