Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms