Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms