Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms