Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB2BQ9BVA1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms