Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms